科學出版社由中國科學院編譯局與30年代創建的有較大影響的龍門聯合書局于1954年8月合并成立。1993年8月恢復使用“龍門書局”副牌。2007年4月轉制成為科學出版社有限責任公司。2011年7月，中國科技出版傳媒股份有限公司以科學出版社有限責任公司為基礎成立，是中國科技出版傳媒集團的核心企業，科學出版社是中國科技出版傳媒股份公司的核心出版品牌。
科學出版社是中國最大的綜合性科技出版機構。在國內擁有完善的出版、發行網絡，下設沈陽分公司、上海分公司、武漢分公司和成都公司，以及紐約公司、東京公司等19家分、子公司。同時與十幾個國家和地區的100多家出版公司建立了長期的良好合作關系。
科學出版社秉承多年來形成的“高層次、高水平、高質量”和“嚴肅、嚴密、嚴格”的優良傳統與作風，始終堅持為科技創新服務、為普及科學知識服務、為科學家和廣大讀者服務的宗旨，依托中國科學院和“科學家的出版社”的品牌優勢，充分挖掘國內外優良出版資源，重視重大出版工程建設，形成了以科學（S）、技術（T）、醫學（M）、教育（E）、社科（H）為主要出版領域的業務架構。
科學出版社現在每年出書萬余種（含重印書），期刊近300種，形成了重大圖書出版項目、工程集群：“十一五” 國家重點圖書出版規劃項目53個，“十一五”國家級普通高校規劃教材789項，每年大約有120個圖書項目獲國家科學技術學術著作出版基金、中國科學院出版基金、華夏基金資助。科學出版社有25個項目入圍《“十二五”時期國家重點出版物出版規劃》，穩居全國科技出版單位之首。科學出版社擁有一個高水平、高質量、多品種的期刊方陣，30多種期刊收錄入SCI、EI等國際著名檢索系統，是中國科技期刊出版領域的“國家隊”。
自1982年以來，科學出版社在歷屆優秀科技圖書評獎和科技期刊評獎中均名列前茅。1993年榮獲國家首批“全國優秀出版社”稱號。2007年、2010年連續兩屆獲得中國出版政府獎“先進出版單位”。2009年榮膺“全國百佳圖書出版單位”稱號。“十一五”期間獲得的重要圖書獎項有：國家自然科學獎一等獎1項，國家科技進步獎二等獎4項，中華優秀出版物獎3項；7種圖書列入總署“三個一百”原創出版工程獎。在兩屆中國出版政府獎評獎中，科學出版社共獲得15個獎項，其中圖書獎6項，期刊獎2項，網絡出版物獎1項，優秀出版人物獎2項，獲獎總數位列前茅。
科學出版社積極響應中央文化“走出去”戰略部署，致力于推進“走出去”工作，有力地拓展了國際出版業務。近年來，歷年輸出圖書版權均位居全國出版單位前三甲、科技出版社之首，先后榮獲全國版權輸出先進單位、2008中國版權最具影響力企業、2008－2009和2009－2010年度國家文化出口重點企業。
科學出版社以集團和股份公司成立為契機，正進一步深化改革，加快資源整合和產業升級的步伐，創新出版形式，多出學術精品，努力成為“中國科技出版旗艦”，成為中國最大的科技內容集成機構和科技信息服務機構，成為國家創新體系知識傳播系統的骨干力量，為開創中國科技出版產業新局面，為促進中國科技國際交流與合作做出更大貢獻。
為整合東北地區出版資源，更好地為東北地區作譯者和讀者服務，科學出版社在沈陽設有東北分社，歡迎有志于在出版行業發展的人才加盟，共創學術出版新天地。